Open-domain web-based multiple document : question answering for list questions with support for temporal restrictors

Tese de doutoramento, Informática (Ciências da Computação), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015With the growth of the Internet, more people are searching for information on the Web. The combination of web growth and improvements in Information Technology has reignited the interest in Question Answering (QA) systems. QA is a type of information retrieval combined with natural language processing techniques that aims at finding answers to natural language questions. List questions have been widely studied in the QA field. These are questions that require a list of correct answers, making the task of correctly answering them more complex. In List questions, the answers may lie in the same document or spread over multiple documents. In the latter case, a QA system able to answer List questions has to deal with the fusion of partial answers. The current Question Answering state-of-the-art does not provide yet a good way to tackle this complex problem of collecting the exact answers from multiple documents. Our goal is to provide better QA solutions to users, who desire direct answers, using approaches that deal with the complex problem of extracting answers found spread over several documents. The present dissertation address the problem of answering Open-domain List questions by exploring redundancy and combining it with heuristics to improve QA accuracy. Our approach uses the Web as information source, since it is several orders of magnitude larger than other document collections. Besides handling List questions, we develop an approach with special focus on questions that include temporal information. In this regard, the current work addresses a topic that was lacking specific research. A additional purpose of this dissertation is to report on important results of the research combining Web-based QA, List QA and Temporal QA. Besides the evaluation of our approach itself we compare our system with other QA systems in order to assess its performance relative to the state-of-the-art. Finally, our approaches to answer List questions and List questions with temporal information are implemented into a fully-fledged Open-domain Web-based Question Answering System that provides answers retrieved from multiple documents.Com o crescimento da Internet cada vez mais pessoas buscam informações usando a Web. A combinação do crescimento da Internet com melhoramentos na Tecnologia da Informação traz como consequência o renovado interesse em Sistemas de Respostas a Perguntas (SRP). SRP combina técnicas de recuperação de informação com ferramentas de apoio à linguagem natural com o objetivo de encontrar respostas para perguntas em linguagem natural. Perguntas do tipo lista têm sido largamente estudadas nesta área. Neste tipo de perguntas é esperada uma lista de respostas corretas, o que torna a tarefa de responder a perguntas do tipo lista ainda mais complexa. As respostas para este tipo de pergunta podem ser encontradas num único documento ou espalhados em múltiplos documentos. No último caso, um SRP deve estar preparado para lidar com a fusão de respostas parciais. Os SRP atuais ainda não providenciam uma boa forma de lidar com este complexo problema de coletar respostas de múltiplos documentos. Nosso objetivo é prover melhores soluções para utilizadores que desejam buscar respostas diretas usando abordagens para extrair respostas de múltiplos documentos. Esta dissertação aborda o problema de responder a perguntas de domínio aberto explorando redundância combinada com heurísticas. Nossa abordagem usa a Internet como fonte de informação uma vez que a Web é a maior coleção de documentos da atualidade. Para além de responder a perguntas do tipo lista, nós desenvolvemos uma abordagem para responder a perguntas com restrição temporal. Neste sentido, o presente trabalho aborda este tema onde há pouca investigação específica. Adicionalmente, esta dissertação tem o propósito de informar sobre resultados importantes desta pesquisa que combina várias áreas: SRP com base na Web, SRP especialmente desenvolvidos para responder perguntas do tipo lista e também com restrição temporal. Além da avaliação da nossa própria abordagem, comparamos o nosso sistema com outros SRP, a fim de avaliar o seu desempenho em relação ao estado da arte. Por fim, as nossas abordagens para responder a perguntas do tipo lista e perguntas do tipo lista com informações temporais são implementadas em um Sistema online de Respostas a Perguntas de domínio aberto que funciona diretamente sob a Web e que fornece respostas extraídas de múltiplos documentos.Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT), SFRH/BD/65647/2009; European Commission, projeto QTLeap (Quality Translation by Deep Language Engineering Approache

Programa Nacional de Vigilância da Gripe: relatório da época 2010/2011

A época de vigilância da gripe de 2010/2011 caracteriza-se por ser a época posterior à primeira pandemia do século XXI, que esteve associada à circulação de um novo subtipo de vírus influenza, o vírus pandémico A(H1N1)pdm09. Nesta época verificou-se um pico de atividade gripal entre as semanas 50/2010 e 5/2011, com a duração de 8 semanas. Durante este período a taxa de incidência atingiu o valor máximo de 121,12 casos por 100 000 habitantes, na semana 52, sendo a atividade gripal considerada como alta/moderada. Do ponto de vista virológico a época teve uma apresentação bifásica, primeiramente dominada pelos vírus influenza do tipo B da linhagem Victoria, e mais tarde pela circulação dos vírus influenza A(H1)pdm09, sendo estes últimos os detetados num maior números de casos (55,7%). A deteção dos vírus influenza do subtipo A(H3) e do tipo B da linhagem Yamagata foi esporádica, e os vírus influenza A(H1) sazonais não foram detetados. Os vírus estudados foram, antigénica e geneticamente, semelhantes às estirpes incluídas na composição da vacina antigripal disponível para a época. Durante a época de 2010/2011, a maior percentagem de casos de gripe (70,4%) foi detetada no grupo das crianças em idade escolar (5-14 anos). Nestas, a doença esteve particularmente associada à infeção com vírus influenza do tipo B, enquanto que a infeção com vírus influenza do tipo A ocorreu, maioritariamente, na população adulta. Na época em estudo ocorreu uma redução na cobertura da vacina antigripal sazonal, na população geral em todos os grupos etários à exceção dos 45-64 anos e em todos os grupos que declararam sofrer de doenças crónicas, à exceção dos diabéticos. Apesar de nenhuma destas diferenças ser estatisticamente significativa, a sua observação concomitante deverá ser considerada como um alerta, incentivando assim o reforço da campanha de vacinação nos grupos alvos prioritários para a vacinação antigripal

Programa Nacional de Vigilância da Gripe: Resultados da Atividade Gripal em Portugal na Época 2010/2011

Introdução: A vigilância epidemiológica da gripe, doença associada a uma elevada mortalidade em idosos e indivíduos pertencentes a grupos de risco, é essencial para a caraterização das epidemias de gripe bem como para a monitorização da ocorrência de surtos e do surgimento de estirpes virais resistentes aos antivirais. Material e Métodos: No presente estudo analisaram-se os dados da vigilância epidemiológica da gripe durante o Inverno de 2010/2011. Os dados clínicos, epidemiológicos e virológicos referentes aos casos de síndroma gripal foram recolhidos através do Programa Nacional de Vigilância da Gripe, coordenado pelo Laboratório Nacional de Referência para o Vírus da Gripe (LNRVG) em colaboração com o Departamento de Epidemiologia (DEP) do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (INSA) e com a Direção-Geral da Saúde (DGS). Resultados: A análise dos dados recolhidos mostra que, durante a época de inverno de 2010/2011, a atividade gripal foi moderada/ alta com um período epidémico de 8 semanas, entre as semanas 50/2010 e 5/2011, com um pico de 121,12 casos por 100 000 habitantes na semana 52/2010. Discussão: Os vírus influenza do tipo B (linhagem Victoria) predominaram no início da época até à semana 1/2011, altura em que passaram a predominar os vírus influenza A(H1)pdm09. A maior proporção de casos de gripe foi encontrada no grupo etário das crianças entre os 5 e os 14 anos de idade. Os vírus caracterizados quer antigénica quer geneticamente, foram semelhantes às estirpes incluídas na vacina da gripe sazonal de 2010/2011, apresentando algumas substituições de aminoácidos em locais antigenicamente importantes. A maioria das estirpes do vírus A(H1)pdm09 permanecem ainda sensíveis ao oseltamivir e ao zanamivir, tendo sido detetados alguns casos esporádicos de vírus resistentes ao oseltamivir. Até à data, o LNRVG detetou a existência da substituição H275Y no gene da neuraminidase, associada à resistência ao oseltamivir, em 3 vírus A(H1)pdm09 analisados. Para um deles, a resistência ao oseltamivir foi confirmada por ensaios fenotípicos. Conclusão: Apesar do receio associado à emergência de um novo vírus pandémico (rápida dispersão, elevada morbilidade e mortalidade), as características clínicas e epidemiológicas da infeção pelo vírus influenza A(H1)pdm09, revelaram-se, no decorrer de duas épocas (2009/2010 e 2010/2011), muito semelhantes às da gripe sazonal, sendo no entanto de salientar que na época da pandemia (2009/2010) ao vírus da gripe A(H1N1)pdm09 estiveram ligadas características particulares no que diz respeito à sua distribuição temporal, aos grupos etários mais afetados, aos casos de infecção grave e de óbito e fatores de risco associados

Pré-natal odontológico nos postos de saúde de Passo Fundo/RS

Considerando a importância da saúde bucal em gestantes, este estudo pesquisou como funciona o Sistema Único de Saúde - SUS, no município de Passo Fundo - RS, na área de atendimento odontológico junto às enfermeiras responsáveis pelas unidades básicas de saúde, as quais são responsáveis pelo pré-natal. Verificou-se a realização e acompanhamento do pré-natal odontológico pelos cirurgiões dentistas com a finalidade de conhecer o tipo de informações transmitidas às gestantes sobre a importância do pré-natal odontológico, e também como os cirurgiões dentistas desenvolvem o atendimento odontológico durante o período gestacional, além de orientações em programas de atendimento coletivo. Diante disso pode-se observar que os cirurgiões dentistas que atuam nas unidades básicas de saúde da cidade de Passo Fundo - RS desenvolvem o pré-natal odontológico, porém não preconizam o atendimento coletivo com base nos programas que preveem organização de grupo de pacientes recebendo informações orientações através de palestras e outras atividades semelhantes. As conclusões apontaram que há atendimento nas unidades de saúde pública, todavia não há profissionais em número suficiente para atender a demanda e cumprir programação de atendimento preventivo coletivo

Programa Nacional de Vigilância da Gripe: relatório da época 2011/2012

O Programa Nacional de Vigilância da Gripe tem como objectivo a recolha, análise e disseminação da informação sobre a atividade gripal, identificando e caracterizando de forma precoce os vírus da gripe em circulação em cada época bem como a identificação de vírus emergentes com potencial pandémico e que constituam um risco para a saúde pública, procurando contribuir, desta forma, para a diminuição da morbilidade e mortalidade associada à infecção e suas complicações. As informações resultantes da vigilância permitem ainda a orientação de medidas de prevenção e controlo da doença de forma precisa. Com a elaboração deste relatório pretende-se proceder à descrição e divulgação dos resultados obtidos na época de inverno de 2011/2012, efectuando uma síntese da atividade gripal em Portugal durante esta época. Na época 2011/2012 foram notificados um total de 962 casos de SG. A atividade gripal foi considerada alta / moderada e o maior número de notificações foi observado entre final de Janeiro e a primeira quinzena de Março, com um pico de ocorrência na semana 9/2012. As taxas de incidência semanais do SG mantiveram-se acima da área de atividade basal durante 9 semanas consecutivas, entre as semanas 4/2012 e 12/2012, com um valor máximo de 137,71 casos de SG por 100 000 habitantes na semana 10/2012. Mais de metade das notificações tiveram origem em indivíduos do género feminino. O grupo etário mais representado foi o correspondente à população jovem/adulta com idades compreendidas entre os 15 e os 44 anos, embora a distribuição semanal das taxas de incidência revele uma maior incidência da doença no grupo etário correspondente às crianças em idade escolar dos 0-4 anos e maiores de 65 anos. O início súbito e o mal-estar, debilidade ou prostração foram os sintomas/sinais mais frequentes. A vacina antigripal foi administrada a 20,7% dos casos notificados, com a maior proporção de casos vacinados a ser observada no grupo etário dos idosos (≥65 anos). A análise laboratorial a 678 exsudados da nasofaringe revelou a presença de vírus influenza em 39,2% dos exsudados. Dos 266 vírus influenza identificados, 97,7% pertenciam ao subtipo A(H3) e 2,3% pertenciam à linhagem Yamagata dos vírus influenza do tipo B. Os vírus dos subtipos A(H1)pdm09 e A(H1) sazonal não foram identificados nos casos estudados. Os vírus influenza A(H3), predominantes na época 2011/2012 foram detetados entre a semana 51/2011 e 18/2012. A maior percentagem de casos de gripe foi verificada nas crianças com idade compreendida entre os 5 e os 14 anos. A análise antigénica e genética realizada revelou que, na sua maioria, os vírus identificados foram semelhantes às estirpes que constituíram a vacina antigripal desta época. As estirpes de vírus influenza estudadas são susceptíveis aos inibidores da neuraminidase e resistentes aos adamantanos. O diagnóstico diferencial de vírus respiratórios detetou a presença em maior frequência de Rhinovírus humano, seguido de Vírus Sincicial Respiratório e vírus Parainfluenza

Psychometric properties of the Portuguese version of the invalidating childhood environment scale

Purpose The current study aimed to examine the psychometric properties of the Portuguese version of the invalidating childhood environment scale (ICES) in a non-clinical and clinical sample of eating disorder (ED) patients. This study also investigated the between-sample differences regarding invalidating parental behaviors and family styles and explored the associations between invalidating childhood environments and eating pathology. Methods A sample of 410 high school and college students and 101 patients with a diagnosis of ED completed self-report measures. Principal component analyses and confirmatory factor analyses were conducted to examine the factor structure of the ICES. The internal consistency and the between-sample differences and associations between invalidating childhood environments and eating pathology were also tested. Results Principal component analyses and confirmatory factor analyses indicated a two-factor solution for each parent. The ICES demonstrated high internal consistency and was able to differentiate between non-clinical and clinical samples. The perception of parental invalidation was higher in ED patients, and the clinical sample presented higher scores in the chaotic and perfect family styles and lower scores in the validating family style, in comparison with the non-clinical sample. Both maternal invalidation and invalidating styles were significantly associated with a higher ED symptomatology. Conclusions The Portuguese version of the ICES revealed adequate psychometric properties. Considering the relationship between invalidation in family and eating pathology, the ICES may be useful in clinical practice, especially among ED patients. Level of Evidence Level V, cross-sectional descriptive study.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Influenza Vaccine Effectiveness in Portugal: Season 2011-12. Final Report

The EuroEVA project is the Portuguese component of the multicentre I-MOVE study and aims to obtain estimates of the seasonal and pandemic vaccine effectiveness during and after the influenza season. Since the 2008/2009 influenza season Portugal, along with other European countries, has implemented a common protocol using a case-control study design, where influenza-like illness cases which are laboratory confirmed as influenza (ILI+) are compared to a control group consisting of ILI patients which test negative for influenza (ILI-) (Case-control Test negative design). The results presented in this report relate to the EuroEVA 2011-2012 season and aim to estimate the seasonal influenza vaccine effectiveness for the age group 60+ years and in all age groups, using two approaches: Case-control Test negative design and Screening Method. Materials and Methods Test Negative Design ILI cases were identified among patients that presented ILI symptoms to a participating EuroEVA General Medical Practitioner (GP). On a weekly basis, each GP systematically selected ILI patients (two per week with less than 60 years and all ILI patients with 60 years and more) using the EU ILI case definition. Data on potential confounding factors and effect modifiers was collected using a standardized questionnaire which included information on socio-demographic variables (age, gender, education and co-inhabitants), previous (2010-11) influenza vaccination, chronic conditions and related hospitalizations, current smoking habits, belonging to GP list and number of consultations in the previous year. An ILI patient was considered vaccinated if he/she had received one dose of the 2011/2012 trivalent influenza vaccine at least 14 days prior to onset of symptoms. VE was estimated as one minus the odds ratio of being vaccinated in cases versus controls adjusted for confounders by logistic regression. Potential confounders were investigated and included if: they changed crude OR estimate in at least 10% after adjustment by the Mantel-Haenszel method, were associated both to being a case (in the absence of the exposure factor) and to the seasonal vaccination. Screening Method ILI cases and ILI laboratory confirmed influenza cases were recruited in the context of the National I-MOVE case-control study (EuroEVA). Vaccine coverage in the population was obtained from a sample of 1074 households stratified by region (homogeneous allocation) selected from a dual sample frame: random digit dialling mobile and landline phones (ECOS sample). Relevant information was collected by CATI (Computer Assisted Telephone interview) – one respondent by household (proxy for the rest of the household members). VE was estimated by comparing the proportion of vaccinated cases to the vaccine coverage in the source population, using the Orenstein formula and the Farrington method to adjust for age group and target group for vaccination. Results In Portugal, a later beginning of the 2011/2012 influenza epidemic was observed, starting in week 4/2012 and ending at week 12/2012. In this season both influenza B and A(H3) virus types were circulating, with predominance of the later. Test negative design From the 59 GP’s that accepted to participate in the study, 35 effectively participated in the study by selecting patients (which corresponds to a 59% participation rate). After excluding 79 ILI cases (for not adhering to the inclusion criteria) the final sample consisted on 273 ILI patients. Of the 134 cases which tested positive for influenza, 98.5% were positive for influenza A(H3) and the remaining for type B virus. The control group, consisting of 139 ILI patients who tested negative for influenza, was statistically different (p<0.05) from the ILI+ group in the following variables: • Clinical signs and symptoms: cough (higher in cases than in controls: 95.5% vs. 89.2%, respectively) and sore throat (more frequent in controls, 89.2%, than in cases ,75.4%); • Age: controls were older than cases (median age in controls was 52 yrs vs. 39 yrs in cases); • Any chronic disease: the prevalence of at least one chronic condition relevant for influenza vaccination was higher in controls (41.7% vs 29.1%); • Seasonal vaccine in 2010-11: controls were more often vaccinated against influenza in the last season than cases (30.2% vs. 14.4%); • Co-habitants: the median number of co-habitants was higher in cases (3 vs. 2). Considering all population, vaccine coverage (VC) in controls was 27.5% statistically higher than in cases (VC=13.4%). Similar results were obtained for the sub-group target for vaccination by the National Health Authorities (VC cases =24.6% and VC controls=46.1%, p=0.010). These results indicate that crude VE estimates was 59.2% (95% CI: 21.1%-79.4%) in the general population and 61.8% (95% CI: 15.5% ;83.1%) in the target group for vaccination. After adjustment for co-inhabitants and month of onset of illness, VE adjusted estimates were 48.8% (95% CI: 0.0% ; 73.8%) and 51.6% (95% CI:-6.2%-77.9%) for the general population and for the target group, respectively. Screening Method The ECOS telephone survey was conducted during April 2012, and information was obtained from a total of 2395 individuals. According to the results, individuals were vaccinated from October 2011 through January 2012, estimating a 16.4% (95% CI: 13.6-19.6) vaccine coverage (VC) in the population. In the 60+ yrs age group, the VC was 37.3% (95% CI: 30.6-44.4) and for the individuals with chronic condition was 28.0% (95% CI: 23.0-33.7). The crude VE estimated with the Screening method for ILI+ as the outcome was 27.0% (95% CI: -19.9- 55.6) and -32.4% (95% CI: -77.7- 1.3) for ILI. Adjusted VE estimates varied from -90.4% (95% CI: -277.1- 3.9) (60+ yrs) to 6.1% (95% CI: -56.0- 43.4) (0-60 yrs) considering ILI as the outcome and from -58.6% (95% CI: -195.3- 14.8) to 56.9 (95% CI: -35.2- 86.3) for ILI positive outcomes (none were statistically significant). Conclusions Given the 3 years experience in conducting this study, logistical and implementation aspects were straightforward. The 2011-2012 season adjusted VE estimates were similar for the general population (48.8%) and for the target group (51.6%), although not statistical significant. When compared to the previous season, VE point estimate for the general population was lower (VE=58% in 2010-11), although the CI overlap. The population studied this year was older than in the last season. The time between onset of symptoms and swabbing, was also different with marginally, non significant, differences between cases and controls.ECD

Inseminação Artificial Homóloga: repercussão no direito de sucessão

The present work deals with the implications of homologous post mortem artificialinsemination in inheritance law, and aims to address the controversy around the theme, including therules published by the Federal Council of Medicine. To this end, methodologies of specific readings onthe subject were used, through documentary and bibliographic research, in addition to works publishedwith the aim of elucidating doubts on the subject, through the exploratory method. In view of this, itwas allowed to infer that, although the Civil Code does not provide for the call for the succession of thechild conceived after the death of the parent, the legislator did not want to exclude his patrimonialrights, in view also not to insert, in a specific role, the said disinheritance hypothesis.O presente trabalho trata das implicações da inseminação artificial homóloga postmortem no direito sucessório, e tem por objetivo abordar a polêmica em torno do tema,inclusive as normas editadas pelo Conselho Federal de Medicina. Para tanto, utilizaram-semetodologias de leituras específicas sobre o assunto, através de pesquisa documental ebibliográfica, além de trabalhos publicados com o fito de elucidar as dúvidas sobre o assunto,por meio do método exploratório. Diante disso, permitiu-se inferir que, muito embora oCódigo Civil não faça previsão ao chamamento à sucessão do filho concebido após ofalecimento do genitor, não quis o legislador excluir seus direitos patrimoniais, tendo em vistatambém não inserir, em rol específico, a referida hipótese de deserdação

Notícias EuroEVA 2010-2011: Resultados Finais

A vacinação é uma das principais medidas de mitigação da gripe sendo reconhecido o seu papel na redução do risco de contágio da doença e de ocor-rência das respectivas complicações1. Desde 2008, o Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, I.P. (INSA) com o apoio da Associação Portuguesa de Médicos de Clínica Geral, tem parti-cipado através do estudo EuroEVA no projecto europeu multicêntrico I-MOVE (Monitoring influenza vaccine efective-ness during influenza seasons and pan-demics in the European Union). Este projecto é coordenado pela EpiConcept SARL e financiado pelo ECDC e tem como objectivo estimar a efectividade da vacina sazonal e pandémica durante e após a época de gripe. Os países que participam neste pro-jecto, desenvolvem anualmente um estudo com delineamento caso-controlo, tendo como base um proto-colo comum. Nesta época, 2010-11, o projecto I-MOVE contou com a participação de Por-tugal, Espanha, Itália, França, Polónia, Hungria, Irlanda e Roménia e tinha como objectivo estimar a efectividade da vaci-na (EV) antigripal sazonal na população geral e nos mais idosos (com 65 e mais anos). Os resultados que agora apresentamos referem-se ao estudo EuroEVA 2010-11 e correspondem ao período decorrido entre a semana 45/2010 e a semana 11/2011.European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC